SysBioM

Centro Interdipartimentale

Molecular Systems Biology

Sistemi Complessi in Biologia e Medicina Molecolare

 

Ultimo aggiornamento: 30/06/2010 17.32

 

Università degli Studi di Torino

 

 

Strutture afferenti

Dipartimento di Fisica Teorica

Dipartimento di Informatica

Dipartimento di Scienze Cliniche e Biologiche

Dipartimento di Scienze Oncologiche

Dipartimento di Biologia Animale e dell'Uomo

 

FINALITA'

Scopo del Centro è quello di promuovere e svolgere attività di ricerca e formazione nel  campo dei sistemi complessi in biologia molecolare ed in medicina molecolare e della biologia dei sistemi molecolari. Questa disciplina richiede un approccio di studio teorico e pratico di tipo fortemente  interdisciplinare, che coinvolge la matematica, l’informatica e la fisica teorica, accanto alla biologa molecolare. I campi di applicazione primari sono l’analisi genomica e post-genomica, le strutturistica macromolecolare, le interazioni macromolecolari complesse, i network di segnalazione intracellulare e l’analisi morfo-funzionale cellulare.

La missione essenziale del Centro è quello di promuovere l’interazione e l’integrazione di competenze diverse al fine di realizzare progetti di ricerca e di formazione interdisciplinari, nel campo della biologia post-genomica e della Systems Biology.

Il Centro si propone di promuovere ampia collaborazione scientifica con enti di ricerca pubblici e privati nazionali ed internazionali, con altri centri universitari e con centri di ricerca applicativa, per fini coerenti agli obiettivi istituzionali.

 

MISSION

The aim of this Center is to promote and develop research and education in the field of complex systems in molecular biology & medicine and in molecular systems biology. This discipline requires a strongly interdisciplinary approach at both the theoretical and practical settings, involving mathematics, computer sciences and theoretical physics, together with molecular biology.

Primary application fields are genomics and post-genomics, macromolecular structures, complex macromolecular interactions, intracellular signaling networks and morpho-functional analysis.

The mission of the Center is to promote interaction and integration of diverse competencies, in order to realize research projects and education in the fields of post-genomic biology and Systems biology.

The Center will also promote wide international scientific collaboration with public and private research Institutes as well as with other Universities and Centers for translational research, for all activity coherent with the institutional commitments. 

ATTIVITA' FORMATIVA - CORSI- CONGRESSI – SEMINARI - AVVISI

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12 Luglio 2010 – 2 pm –IRCC-Biblioteca

MOLECULAR BIOLOGY LECTURES Series

Luciano Di Croce

CRG - Center for Genomic Regulation

Barcelona, Spain

Epigenetic mechanisms of mammalian gene regulation in normal and cancerous cells”

 

Download PDF 

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CONFERENCE  ECML / PKDD

Workshop on Dynamic Networks and Knowledge Discovery  (DyNaK 2010)

24 Settembre -  Barcellona ECML/PKDD
all'interno della conferenza, un workshop organizzato dai nostri Informatici e sponsorizzato da SysBioM.

SITO WEB CONFERENZA

Call for papers

 

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Synthetic life.

The paper published recently by Craig Venter’s group, greatly over-exposed on media.

SCIENCE paper link

 

Pubblichiamo volentieri un commento che ci è stato inviato dal Prof. Gribaudo a nome della Società Italiana di Microbiologia:

COMMENTO (italiano)  COMMENTARY (english)

Lettera Gribaudo

 

 

 Sede Amministrativa e CGA

Dipartimento di Scienze Oncologiche dell’Università degli studi di Torino – presso IRCC, SP142, 10060 Candiolo (Torino) Tel. 011 9933614 / 3419

 

 SysBioM presso il
BioIndustry Park del Canavese

Dottorato di Ricerca "Sistemi Complessi Applicati alla Biologia Post-genomica 

 


 

STRUTTURE

IRCC

Unità di Bioinformatica

 

 

 

CONTATTI

Tel. 011 670 4689 (con segr.)

Fax 011 236 4689

E.mail: biomol_cosys@unito.it

gianfranco.gilardi@unito.it

federico.bussolino@ircc.it

raffaele.calogero@unito.it

caselle@to.infn.it

marco.botta@unito.it

michele.debortoli@unito.it

 

 

 

LINEE DI RICERCA

Reti di controllo dell’espressione genica

Epigenetica e controlli genetici globali

Reti di trasduzione del segnale cellulare

Reti di interazione macromolecolare

Strutturistica e modellistica delle proteine

Design di biochips di array proteici

Sviluppo di strumenti tecnologici per la produzione ed analisi di dati biologici

Biosensori con sistemi molecolari auto-assemblati

Genetica e genomica comparativa e di sistemi

Modelli matematici per l’interpretazione di fenomeni biologici

Metodologie informatiche per la gestione e l’analisi di dati biologici

Metodologie informatiche a supporto dell’interpretazione di fenomeni biologici

      RECENT PAPERS

Orso F, Corà D, Ubezio B, Provero P, Caselle M, Taverna D.
Identification of functional TFAP2A and SP1 binding sites in new TFAP2A-modulated genes.
BMC Genomics. 2010 Jun 3;11:355.

Cicatiello L, Mutarelli M, Grober OM, Paris O, Ferraro L, Ravo M, Tarallo R, Luo S, Schroth GP, Seifert M,   Zinser C,   Chiusano ML,   Traini A,       De Bortoli M, Weisz A.
Estrogen receptor alpha controls a gene network in luminal-like breast cancer cells comprising multiple transcription factors and microRNAs.
Am J Pathol. 2010 May;176(5):2113-30.

Visconti A, Cordero F, Botta M, Calogero RA.
Gene Ontology rewrited for computing gene functional similarity. In Proceeding of the third International Workshop on Intelligent Informatics     in Biology and Medicine (IIBM 2010) IEEE Computer Society Press.
[in press]

Fortunati N, Bertino S, Costantino L, De Bortoli M, Compagnone A, BandinoA, Catalano M, Boccuzzi G

Valproic acid restores ER alpha and antiestrogen sensitivity to ER alpha-negative breast cancer cells.

Mol Cell Endocrinol. 2010 Jan 15;314(1):17-22.

 

Cardamone MD, Bardella C, Gutierrez A, Di Croce L, Rosenfeld MG, Di Renzo MF,  De Bortoli M.

ERalpha as ligand-independent activator of CDH-1 regulates determination and maintenance of epithelial morphology in breast cancer cells.

Proc Natl Acad Sci U S A. 2009 May 5;106(18):7420-5.

 

Re A, Corá D, Taverna D, Caselle M.

Genome-wide survey of microRNA–transcription factor feed-forward regulatory circuits in human.

Mol. BioSyst., 2009, DOI: 10.1039/b900177h

 

Orso F, Jager R, Calogero RA, Schorle H, Sismondi P, De Bortoli M, Taverna D.

AP-2alpha regulates migration of GN-11 neurons via a specific genetic programme involving the Axl receptor tyrosine kinase.

BMC Biology 2009, 7:25.

Cordero F, Pensa R.G., Visconti A, Ienco D, Botta M Ontology-driven Co-clustering of Gene Expression Data. In Proceedings of the 11th Conference of the Italian Association for Artificial Intelligence AIIA.  LNAI 5883 Springer pp 426-435. December 9-12,    2009, Reggio Emilia, Italy. ISSN: 0302-9743.

 

 

 

 

     POSITIONs AVAILABLE